Detectan evidencia de Variantes de Coronavirus en aguas residuales

Detectan evidencia de Variantes de Coronavirus en aguas residuales

OKLAHOMA CITY, OKLA. - Investigadores de la Universidad de Oklahoma, OU Health y la Oklahoma Medical Research Foundation han identificado la presencia de varias mutaciones dentro de genomas del nuevo coronavirus, SARS-CoV-2, en muestras de aguas residuales recogidas en todo Oklahoma en enero.

Las mutaciones que se detectaron en las aguas residuales de Oklahoma en enero pasado son indicativas de tres variantes emergentes de coronavirus preocupantes: la variante "Pelican", un linaje recientemente identificado que se encuentra en gran parte en los Estados Unidos, así como varias mutaciones que son comunes en las variantes B.1.1.7 y B.1.351, originarias del Reino Unido y Sudáfrica, respectivamente. Ninguna de las mutaciones que son marcadores de la variante P.1 originaria de Brasil se detectó en los sitios de investigación. Las mutaciones indicaron que potencialmente había más variantes infecciosas en diferentes niveles en las aguas residuales para los diferentes sitios monitoreados.

Según los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC), muchas personas infectadas con COVID-19 arrojaron el virus en sus desechos antes de desarrollar síntomas. Debido a esto, los municipios y universidades de todo el mundo están monitoreando las aguas residuales para el nuevo coronavirus, SARS-CoV-2, que causa COVID-19, que puede servir como un indicador temprano de posibles brotes.

Durante los últimos meses, el equipo de OU ha trabajado en colaboración con varias ciudades en todo el estado para recoger y analizar las aguas residuales para la presencia de material genético SARS-CoV-2. Comenzando con el muestreo de aguas residuales en el campus de OU Norman, los esfuerzos de investigación se han ampliado desde entonces, con muestras de aguas residuales crudas de plantas de tratamiento de aguas residuales en Oklahoma City, Midwest City, Norman, Anadarko y Tulsa, y de alcantarillas en 14 ubicaciones en Oklahoma City.

"Al analizar las aguas residuales recogidas de áreas geográficamente distintas que representan una población específica, se pueden identificar lugares que experimentan niveles más altos del virus, y se pueden implementar esfuerzos adicionales de mitigación para poblaciones específicas", dijo Jason Vogel, Ph.D., director de la Encuesta de Agua de Oklahoma y profesor de la Escuela de Ingeniería Civil y Ciencias Ambientales de la OU.

"Comprender la progresión de la pandemia en nuestras comunidades a lo largo del tiempo puede informar acciones, como el uso estratégico de recursos limitados, esfuerzos de divulgación y pruebas y vacunas específicas, lo que permite a los líderes de Oklahoma mitigar de manera más efectiva y equitativa los impactos de COVID-19", dijo Halley Reeves, vicepresidenta de Impacto comunitario en la salud de OU health.

"El análisis de muestras de aguas residuales es actualmente la mejor y más rápida manera de obtener conocimiento a nivel poblacional sobre las variantes genéticas que se transmiten en Oklahoma", dijo Katrin Kuhn, Ph.D., epidemióloga de enfermedades infecciosas y profesora asociada en OU Hudson College of Public Health. "El conocimiento de cuántas de estas variantes están circulando en la población, y dónde se transmiten, nos ayuda a prepararnos mejor para el impacto de un posible brote de una variante genética."

La secuenciación de esta investigación fue completada por OMRF en Oklahoma City.

"La tecnología de OMRF nos permite analizar muestras para esta investigación a un nivel y velocidad no disponible en ningún otro lugar del estado", dijo el científico de OMRF Graham Wiley, Ph.D. "Esta es la ciencia hecha por los oklahomans en beneficio de los oklahomans. Identificar qué variantes del virus están presentes y dónde se encuentran dentro del área metropolitana y las ciudades circundantes es fundamental para la salud pública".

"Nos estamos coordinando con otros grupos en todo Estados Unidos y en todo el mundo para monitorear la evolución y propagación de variantes", dijo Bradley Stevenson, Ph.D., profesor asociado de microbiología en OU. 

Este proyecto también centra las bases para la investigación en otras crisis de salud"

Reeves reiteró lo grande que es tener un equipo de investigación fuerte en Oklahoma City.

"Como hemos visto en esta pandemia cuando nos enfrentamos a problemas verdaderamente desafiantes, son equipos como este grupo intersectorial de expertos y líderes comunitarios los que salen de sus entornos de trabajo normales para desarrollar soluciones innovadoras que satisfagan las necesidades de nuestras comunidades", dijo Reeves.

El equipo de vigilancia de aguas residuales de OU está compuesto por Bryce Lowrey, Stevenson, Vogel, Kuhn, Reeves, varios técnicos  y docenas de estudiantes de pregrado de OU.